This study investigated biological characteristics of recovered stressed M. tuberculosis isolates that failed to grow in differential culture media for phenotypic identification and in culture media containing anti-tuberculosis drugs for drug-susceptibility testing, despite of having grown in primary culture. It represents an improvement in the diagnosis of MDR tuberculosis and tuberculosis control.

O gênero Mycobacterium é constituído por espécies do complexo M. tuberculosis e outras denominadas micobactérias não-tuberculosas (MNT). Até o momento, mais de cem MNT foram descritas. Os objetivos deste estudo foram avaliar a diversidade das espécies de MNT identificadas no estado de São Paulo, no período de 1991 a 1997, que antecedeu a expansão da terapia anti-retroviral, e determinar a freqüência dos casos que atenderam alguns critérios bacteriológicos para o diagnóstico das infecções causadas pelas MNT. MATERIAL E MÉTODOS: Foram analisadas 1.892 cepas isoladas de sítios estéreis e não-estéreis de 1.248 pacientes atendidos no estado de São Paulo. RESULTADOS: Do total de pacientes, 1.199 (96,1%) tiveram suas cepas identificadas e 3,9% apresentaram resultados não-conclusivos. As dez espécies encontradas foram o complexo M. avium (MAC), M. kansasii, M. chelonae, M. fortuitum, M. szulgai, M. xenopi, M. marinum, M. gordonae, M. terrae e M. nonchromogenicum. Quarenta e sete (7,8%) casos pulmonares tiveram diagnóstico confirmado pelo isolamento da mesma espécie em três ou mais amostras e 67 (34%) pacientes tiveram o diagnóstico bacteriológico confirmado por isolamento em sítios estéreis. CONCLUSÕES: As espécies de MNT mais freqüentemente isoladas no estado de São Paulo foram MAC e M. kansasii. Uma publicação nacional com recomendações para diagnóstico e tratamento dessas infecções seria fundamental para a conduta correta no diagnóstico e no tratamento de micobacterioses.

INTRODUCTION: Mycobacterium genus includes species of M. tuberculosis complex and others called non-tuberculous mycobacteria (NTM). So far, more than 100 species of NTM have been described. The objectives of this study were to estimate the NTM species diversity among strains isolated in São Paulo State from 1991 to 1997, before the expansion of antiretroviral therapy, and to evaluate the rate of cases that fall under diagnostic criteria for bacteriological diagnosis of NTM infections. MATERIAL AND METHODS: 1,892 strains were isolated from sterile and non-sterile sites of 1,248 patients. RESULTS: 1,199 (96%) were identified as M. avium complex (MAC), M. kansasii, M. chelonae, M. fortuitum, M. szulgai, M. xenopi, M. marinum, M. gordonae, M. terrae or M. nonchromogenicum whereas 49 (3.9%) couldn't be identified up to species. Forty-seven (7,8%) cases from pulmonary sites were confirmed based on strains isolated from three or more samples from the same patient and 67 (34%) patients had NTM isolated from sterile sites, which confirmed the bacteriological diagnosis. CONCLUSIONS: MAC and M. kansasii were the most frequently especies isolated in São Paulo state. National recomendations for the diagnosis and treatment of NTM infections would be useful for correct management of NTM infections.

Mycobacterium kansasii is the most common cause of pulmonary nontuberculous mycobacteria infection and classical identification of this pathogen needs a time consuming phenotypic tests. Polymerase chain reaction-restriction fragment lenght polymorphism analysis (PRA) of the gene enconding for the 65kDa heat shock (hsp65) protein offers an easy, rapid, and inexpensive procedure to identify and subtype M. kansasii isolates. In the present study, we performed a retrospective analysis of patients who had mycobacteria identified on the basis of phenotypic tests by means of a review of database at Mycobacteria Laboratory of the Instituto Adolfo Lutz in the period 1995-1998. A total of 9381 clinical isolates were analyzed of which 7777 (82.9%) were identified as M. tuberculosis complex and 1604 (17.1%) as nontuberculous mycobacteria. Of the 296 M. kansasii isolates, 189 (63.8%) isolates obtained from 119 patients were viable and were analyzed by PRA-hsp65. Hundred eight two (98.9%) were classified as M. kansasii type I. Two isolates were classified as type II and III and five isolates were characterized as other Mycobacterium species. Clinical isolates of M. kansasii in the state of São Paulo was almost exclusively subtype I regardless of HIV status.

O resultado da identificação convencional do complexo Mycobacterium tuberculosis (MT) é demorado. O objetivo deste estudo foi avaliar um teste de triagem para identificação presuntiva de MT e agilização da informação preliminar do resultado, baseado na análise da morfologia da colônia e da visualização de corda no exame microscópico do esfregaço feito da cultura. De janeiro de 1998 a dezembro de 1999 foram analisadas 3056 culturas no Instituto Adolfo Lutz, São Paulo, Brasil. As culturas classificadas como micobactérias não tuberculosas foram submetidas ao teste de identificação por método convencional (testes de crescimento em cultura e bioquímicos) e as MT foram submetidas ao teste de sensibilidade às drogas. Os resultados de sensibilidade, especificidade, valores preditivos positivo e negativo, obtidos com a comparação da identificação presuntiva de MT com o teste de triagem proposto e a identificação final com o método convencional, foram respectivamente 98,9, 86,9, 97,8 e 93,0%. Concluiu-se que a análise da morfologia da colônia e da presença de corda no exame microscópico possibilitou a identificação presuntiva de MT. Este teste pode ser usado pelo laboratório para informação preliminar do resultado presuntivo e para direcionar de maneira prática e com baixo custo, os testes adicionais de sensibilidade às drogas ou de identificação de espécie que serão necessários.

The identification of Mycobacterium tuberculosis complex (MT), using non-molecular methods, is time-consuming. The objective of this study was to evaluate a screening test for the presumptive identification of MT, which could potentially decrease laboratory turn-around time for reporting preliminary results. From January 1998 to December 1999, 3056 cultures were analysed at the Mycobacterial Laboratory, Instituto Adolfo Lutz, São Paulo, Brasil. The screening test consisted of observation of colony morphology on Löwenstein Jensen medium and evaluation of cord formation on smear microscopy from those positive cultures. After the screening test, the cultures identified as non-tuberculous mycobacteria were identified to species by conventional methods (growth on culture and biochemical tests). Those identified as MT were submitted to drug susceptibility tests. The presumptive identification of MT using the proposed screening test, when compared with conventional tests, presented 98.9, 86.9, 97.8 and 93.0% of sensitivity, specificity, positive and negative predictive values, respectively. The conclusion is that it is possible to make a presumptive identification of MT using visual analysis of colony morphology and cord formation on microscopy examination. This method could be used to report the presumptive identification of MT and to guide laboratory decisions regarding susceptibility and identification tests with little cost and in a very practical way.

Anterior a pandemia de AIDS, o Complexo Mycobacterium avium (MAC) era responsável pela maioria das vezes, por pneumopatias acometendo pacientes com doença pulmonar crônica de base como enfisema e bronquite crônica36. Em 1981, com o advento da síndrome de imunodeficiência adquirida (SIDA), o MAC passou a representar uma das doenças bacterianas mais frequentes em pacientes com esta síndrome, sendo a doença disseminada a principal forma de manifestação clínica da infecção8. Entre Janeiro de 1989 e Fevereiro de 1991, no Setor de Micobactérias do Instituto Adolfo Lutz em São Paulo, o MAC foi isolado de 103 pacientes a partir do cultivo de diferentes espécimes estéreis e não estéreis processados, coletados de 2.304 pacientes atendidos no Centro de Referência e Treinamento AIDS e/ou Instituto de Infectologia Emilio Ribas. A doença disseminada foi diagnosticada em 29 destes, com base no isolamento do MAC a partir do sangue e/ou aspirado de medula óssea. Os outros 74 pacientes foram agrupados nas categorias altamente (5), moderadamente (26) e pouco sugestiva de doença (43) de acordo com os postulados de DAVIDSON (1989)10. Os diferentes critérios para valorizar o seu isolamento de espécimes estéreis e não estéreis são discutidos.

Before the AIDS pandemia, the Mycobacterium avium complex (MAC) was responsible in most cases for the pneumopathies that attack patients with basic chronic pulmonary diseases such as emphysema and chronic bronchitis36. In 1981, with the advent of the acquired immunodeficiency syndrome (AIDS), MAC started to represent one of the most frequent bacterial diseases among AIDS patients, with the disseminated form of the disease being the major clinical manifestation of the infection8. Between January 1989 and February 1991, the Section of Mycobacteria of the Adolfo Lutz Institute, São Paulo, isolated MAC from 103 patients by culturing different sterile and no-sterile processed specimens collected from 2304 patients seen at the AIDS Reference and Training Center and/or Emilio Ribas Infectology Institute. Disseminated disease was diagnosed in 29 of those patients on the basis of MAC isolation from blood and/or bone marrow aspirate. The other 74 patients were divided into categories highly (5), moderately (26) and little suggestive of disease (43) according to the criteria of DAVIDSON (1989)10. The various criteria for MAC isolation from sterile and non-sterile specimens are discussed.

O complexo Mycobacterium avium (CMA) é frequentemente isolado de pacientes com complicações tardias de Síndrome de Imunodeficiência Adquirida (AIDS), especialmente na América do Norte e Europa. Entretanto, existem poucos relatos do isolamento deste complexo a partir do sistema nervoso central (SNC) nestes países. Acredita-se que infecções pelo CMA sejam raras entre pacientes portadores de AIDS em países da África e América Latina. Neste trabalho relatamos o isolamento do CMA do líquor de 11 pacientes portadores de AIDS dentre 1723 (0.63%) atendidos no Centro de Referência e Treinamento -AIDS, de São Paulo, e discutimos a significância deste achado.

Mycobacterium avium complex (MAC) is frequently isolated from patients with late complications of Acquired Immunodeficiency Syndrome (AIDS), especially in North America and Europe. However, its isolation from the central nervous system (CNS) has been seldom reported in these countries. MAC infections in AIDS patients in African and Latin American countries are believed to be uncommon. We report the isolation of MAC from cerebrospinal fluid (CSF) of 11 AIDS patients out of 1723 (0.63%) seen at "Centro de Referência e Treinamento - AIDS", São Paulo and discuss the significance of its isolation.

Amostras de líquido cefalorraquidiano (LCR) de 2083 pacientes com Síndrome de Imunodeficiência Adquirida (SIDA) e complicações neurológicas foram examinados durante um período de 7 anos (1984-1990). A porcentagem de pacientes que tiveram pelo menos um agente bacteriano cultivado do LCR foi de 6,2%. Mycobacterium tuberculosis foi o mais frequentemente isolado (4,3%), seguido do complexo Mycobacterium avium ou MAC (0,7%), de Pseudomonas spp (0,5%), Enterobacter spp (0,4%), e Staphylococcus aureus (0,3%). Entre 130 pacientes com cultura positiva, de 89 (68,5%) foi isolado M. tuberculosis e de 15 (11,6%) MAC. A frequência de isolamentos bacterianos aumentou de 1988 (5,2%) a 1990 (7,2%), particularmente devido ao maior isolamento de MAC. Os agentes bacterianos foram mais frequentemente isolados de pacientes na faixa etária de 21-30 anos e de mulheres (p<0.05).

Cerebrospinal fluid (CSF) samples from 2083 patients with acquired immunodeficiency syndrome (AIDS) and neurological complications were bacteriologically examined during a period of 7 years (1984-1990). The percentage of patients who had at least one bacterial agent cultured from the CSF was 6.2%. Mycobacterium tuberculosis was the most frequently isolated agent (4.3%), followed by Mycobacterium avium complex or MAC (0.7%), Pseudomonas spp (0.5%), Enterobacter spp (0.4%), and Staphylococcus aureus (0.3%). Among 130 culture positive patients, 89 (68.5%) had M. tuberculosis and 15 (11.6%) had MAC. The frequency of bacterial isolations increased from 1988 (5.2%) to 1990 (7.2%), partly due to the increase in MAC isolations. Bacterial agents were more frequently isolated from patients in the age group 21-30 years and from women (p<0.05).